在《名侦探柯南》的序幕篇章——第1集“云霄飞车杀人事件”中，主角工藤新一遭遇了命运的转折，他在游乐场无意间目击了黑衣组织的非法交易，不幸被组织成员gin发现并遭袭击，随后被灌下了名为aptx4869的神秘药物，原本以为这药物能结束他的生命，却出乎意料地让新一的身体发生了不可思议的变化——他奇迹般地缩小成了小学一年级的模样，这便是他化名江户川柯南的开始。
在阿笠博士的援手之下,柯南（即工藤新一）开始了他的新生活，寄居于青梅竹马女友毛利兰的父亲——毛利小五郎的家中，他不仅在帝丹小学1年B班秘密进行着小学生身份的生活，还以柯南的身份穿梭于各种案件之间，暗中调查那个让他身陷绝境的神秘黑衣组织。
柯南的生日被巧妙地设定为5月4日,这一日期源自于福尔摩斯与莫里亚蒂教授决战的纪念日，象征着他与对手（或说是命运的挑战）之间的不解之缘，而他的身高，虽在小学一年级的孩童中算是小个子，却也透露出一种微妙的成长与变化，与原身工藤新一那174cm的挺拔身姿形成鲜明对比。
柯南的住址也蕴含着对福尔摩斯的致敬——原居于东京都米花町2丁目21番地（“米花”与“贝克”发音相近），后因缘际会搬至5丁目39番地1号，即毛利侦探事务所所在之处，而他那始终不离身的手机，从最初的索爱W21S到后来的索爱Xperia arc S LT18i，不仅是科技发展的见证，也是他不断探索、永不言弃精神的缩影。
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