广泛涉及，部分关键情节经过独特改编。
在原版故事中，阿莱克希亚的情感倾向是偏向于自己的哥哥，在《暗黑编年史》中，她被塑造成一个冷酷无情的角色，最终竟然勒死了自己的亲哥哥，这一转变为角色增添了更多的复杂性和深度。
虽然原版中克里斯与威斯克之间的决战是一场 *** 戏码，但在《暗黑编年史》中，为了剧情的紧凑性和流畅性，这一场景被巧妙地省略，为其他新情节腾出了空间。
值得一提的是，《暗黑编年史》引入了一个全新的情节线索，讲述了里昂和克劳瑟在南非的故事，这一情节不仅为游戏增添了新的活力，也为玩家提供了全新的游戏体验，无论是通过WI模式还是PC模拟WI，都能带来极佳的游戏感受。
这一系列改动不仅丰富了游戏的剧情层次，也使得玩家在游戏中能够体验到更多的情感张力，每一个角色的转变和情节的重新构建，都为《生化危机：暗黑年代记》增添了更多的神秘色彩和游戏乐趣。
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